Агама туркестанская по внешнему виду и величине очень напоминает кавказскую, отличаясь от нее главным образом неоднородной ребристой чешуей спины, где сильно развитые ребрышки отдельных чешуи сливаются друг с другом, образуя обычно правильные продольные ряды. Сверху она серовато-оливкового, глинистого или буроватого цвета с узкими извилистыми черными полосками и пятнышками. Горло самцов в черных и красновато-оранжевых пятнах, которые у возбужденного животного могут то появляться, то исчезать.